دوره 6، شماره 4 - ( 10-1398 )                   جلد 6 شماره 4 صفحات 415-423 | برگشت به فهرست نسخه ها

XML English Abstract Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Khosroshahi S, Salehghamari E, Amoozegar M A, Saffarian P. Screening methods and enzyme profile of agricultural plant-endophytic bacteria. nbr. 2020; 6 (4) :415-423
URL: http://nbr.khu.ac.ir/article-1-3284-fa.html
خسروشاهی سمانه، صالح قمری انسیه، آموزگار محمد علی، صفاریان پروانه. بررسی روش‌های‌ غربالگری و پروفایل آنزیمی باکتری‌های اندوفیت گیاهی. یافته های نوین در علوم زیستی. 1398; 6 (4) :415-423

URL: http://nbr.khu.ac.ir/article-1-3284-fa.html


گروه علوم سلولی و مولکولی، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه خوارزمی، تهران، ایران ، esaleh@khu.ac.ir
چکیده:   (329 مشاهده)
از آنجایی که در سال ­های اخیر باکتری­ های اندوفیت گیاهی کاربردهای متنوع و مفیدی در بیوتکنولوژی پیدا کرده­اند، توجه زیادی به جداسازی، شناسایی و ارزیابی این نوع میکروارگانیسم ­ها شده است. در این مطالعه با توجه به دشوار بودن سترون سازی سطوح بافت­ های گیاهی از باکتری­ های اپی­فیت، کارایی سه روش مختلف غربالگری باکتری­های اندوفیت شامل 1- استریل کردن با آب ژاول، 2- استریل کردن متناوب (تندال تغییر یافته) و 3- استریل کردن با تریتون X100 و آب ژاول مورد ارزیابی قرار گرفت. روش تندال تغییر یافته روشی ابداعی است که در این پژوهش به منظور حذف مناسب اسپور­های درونی باکتری ­های اپی فیت که در جداسازی اندوفیت­ ها مانع به حساب می ­آیند، به کار رفت. بیش ­ترین تعداد باکتری­ های اندوفیت از گیاهان دولپه ­ای و از برگ جداسازی شدند. همچنین باکتری­ های اندوفیت از نظر تولید آنزیم ­های مختلف هیدرولازی بررسی شدند در این میان آنزیم پروتئاز در طیف وسیعی از باکتری­ های اندوفیت و به مقدار بیشتر از سایر آنزیم­ ها تولید شد. سویه EndoA، مورد شناسایی مولکولی قرار گرفت و مشخص شد که به میزان 100 درصد مشابه Bacillus halotolerans است. 
 

 
متن کامل [PDF 1300 kb]   (95 دریافت)    
نوع مطالعه: مقاله پژوهشی | موضوع مقاله: میکروبیولوژی
دریافت: 1398/4/19 | ویرایش نهایی: 1398/12/5 | پذیرش: 1398/7/24 | انتشار: 1398/10/18 | انتشار الکترونیک: 1398/10/18

فهرست منابع
1. Arnold, A.E. and Engelbrecht, B.M.J. 2007. Fungal endophytes nearly double minimum leaf conductance in seedlings of a neotropical tree species. - J. Tropic. Ecol. 23: 369-372. [DOI:10.1017/S0266467407004038]
2. Bibi, F., Naseer, M.I., Yasir, M., Al-Ghamdi, A.A.K. and Azhar, E.I. 2018. LC-MS based identification of secondary metabolites from marine antagonistic endophytic bacteria. - Genet. Mol. Res. 17: 1-14. [DOI:10.4238/gmr16039857]
3. Bloemberg, G.V. and Carvajal M.M.C. 2006. Microbial interactions with plants: a hidden world. In microbial root endophytes. 321-333. Springer, Berlin, Heidelberg. [DOI:10.1007/3-540-33526-9_18]
4. Carrim, A.J.I., Barbosa, E.C. and Vieira, J.D.G. 2006. Enzymatic activity of endophytic bacterial isolates of Jacaranda decurrens Cham. (Carobinha-do-campo). - Braz. Arch. Biol. Tech. 49: 353-359. [DOI:10.1590/S1516-89132006000400001]
5. Christina, A., Christapher, V. and Bhore, S.J. 2013. Endophytic bacteria as a source of novel antibiotics: an overview. - Pharmacogn. Rev. 7: 11-16. [DOI:10.4103/0973-7847.112833]
6. Cowan, D.A. 1991. Industrial enzymes. In biotechnology, the science and the business eds moses, V. and cape, R.E. pp 311-340. Reading: Harwood Academic Publishers.
7. De Almeida Lopes, K.B., Carpentieri‐Pipolo, V., Fira, D., Balatti, P.A., López, S.M.Y., Oro, T.H. and Degrassi, G. 2018. Screening of bacterial endophytes as potential biocontrol agents against soybean diseases. - J. App. Microbial. 125: 1466-1481. [DOI:10.1111/jam.14041]
8. Gasser, I., Cardinale, M., Müller, H., Heller, S., Eberl, L., Lindenkamp, N., Kaddor, C., Steinbüchel, A. and Berg, G. 2011. Analysis of the endophytic lifestyle and plant growth promotion of Burkholderia terricola ZR2-12. - Plant Soil 347: 125-137. [DOI:10.1007/s11104-011-0833-8]
9. Joshi, S., Singh, A.V. and Prasad, B. 2018. Enzymatic activity and plant growth promoting potential of endophytic bacteria isolated from Ocimum sanctum and Aloe vera. - Int. J. Curr. Microbiol. App. Sci. 7: 2314-2326. [DOI:10.20546/ijcmas.2018.706.277]
10. Kim, M., Morrison, M. and Yu, Z., 2011. Evaluation of different partial 16S rRNA gene sequence regions for phylogenetic analysis of microbiomes. - J. Microbiol. Meth. 84: 81-87. [DOI:10.1016/j.mimet.2010.10.020]
11. Kim, O.S., Cho, Y.J., Lee, K., Yoon, S.H., Kim, M. and Na, H. 2012. Introducing EzTaxon-e: a prokaryotic 16S rRNA gene sequence database with phylotypes that represent uncultured species. - Int. J. Syst. Evol. Micr. 62: 716-721. [DOI:10.1099/ijs.0.038075-0]
12. Liu, Y., Guo, J., Li, L., Asem, M.D., Zhang, Y., Mohamad, O.A., Salam, N. and Li, W. 2017. Endophytic bacteria associated with endangered plant Ferula sinkiangensis KM Shen in an arid land: diversity and plant growth-promoting traits. - J. Arid. Land 9: 432-445. [DOI:10.1007/s40333-017-0015-5]
13. Lodewyckx, C., Vangronsveld, J., Porteous, F., Moore, E.R., Taghavi, S., Mezgeay, M. and der Lelie, D.V. 2002. Endophytic bacteria and their potential applications. - Cr. Rev. Plant Sci. 21: 583-606. [DOI:10.1080/0735-260291044377]
14. Malinowski, D.P. and Belesky, D.P. 2006. Ecological importance of Neotyphodium spp. grass endophytes in agroecosystems. - Grassland Sci. 52: 1-14. [DOI:10.1111/j.1744-697X.2006.00041.x]
15. Malinowski, D.P., Zuo, H., Belesky, D.P. and Alloush, GA. 2005. Evidence for copper binding by extracellular root exudates of tall fescue but not perennial ryegrass infected with Neotyphodium spp. endophytes. - Plant Soil 267: 1-12. [DOI:10.1007/s11104-005-2575-y]
16. Marmur, J. 1961. A procedure for the isolation of deoxyribonucleic acid from micro-organisms. - J. Mol. Biol. 3: 208-218. [DOI:10.1016/S0022-2836(61)80047-8]
17. Ntabo, R.M., Nyamache, A.K., Lwande, W., Kabii, J. and Nonoh, J. 2018. Enzymatic activity of endophytic bacterial isolates from selected mangrove plants in Kenya. - Open Microbiol. J. 12: 354-363. [DOI:10.2174/1874285801812010354]
18. Reece, J.B., Urry, L.A., Cain, M.L., Wasserman, S.A., Minorsky, P.V. and Jackson, R.B. 2014. Campbell biology (No. s 1309). Boston: Pearson.1263 pp.
19. Reinhold-Hurek, B. and Hurek, T. 2011. Living inside plants: bacterial endophytes. - Curr .Opin. Plant. Biol. 14: 435-443. [DOI:10.1016/j.pbi.2011.04.004]
20. Sánchez-López, A.S., Thijs, S., Beckers, B., González-Chávez, M.C., Weyens, N., Carrillo-González, R. and Vangronsveld, J. 2018. Community structure and diversity of endophytic bacteria in seeds of three consecutive generations of Crotalaria pumila growing on metal mine residues. - Plant Soil 422: 51-66. [DOI:10.1007/s11104-017-3176-2]
21. Taechowisan, T., Peberdy, J.F. and Lumyong, S. 2003. Isolation of endophytic actinomycetes from selected plants and their antifungal activity. - World J. Microbiol. Biotechnol. 19: 381-385. [DOI:10.1023/A:1023901107182]
22. Tintjer, T. and Rudgers, J.A. 2006. Grass-herbivore interactions altered by strains of a native endophyte. - New Phytol. 170: 513-521. [DOI:10.1111/j.1469-8137.2006.01720.x]
23. Wejse, P.L. and Ingvorsen, K. 2003. Purification and characterization of two extremely halotolerant xylanase from a novel halophilic bacterium. - Extremophiles 7: 423-431. [DOI:10.1007/s00792-003-0342-7]

ارسال نظر درباره این مقاله : نام کاربری یا پست الکترونیک شما:
CAPTCHA

ارسال پیام به نویسنده مسئول


Creative Commons Licence
This work is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License.




کلیه حقوق این وب سایت متعلق به سامانه نشریات علمی یافته های نوین در علوم زیستی است.

طراحی و برنامه نویسی : یکتاوب افزار شرق

© 2015 All Rights Reserved | Nova Biologica Reperta

Designed & Developed by : Yektaweb