en دستورالعمل ساده و کارآمد استخراج DNA برای برگ‌های قدیمی و هرباریومی تمشکین (تیره مارچوبه‌ایان) علوم گیاهی Plant Biology مقاله پژوهشی Original Article <span style="font-size:11pt"><span style="line-height:normal"><span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span style="font-family:Calibri,sans-serif">&nbsp;<span dir="LTR" lang="EN-CA" style="font-size:10.0pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times="">DNA</span></span><span lang="AR-SA" style="font-size:10.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:"> استخراج شده با کیفیت بالا در بدست آمدن باندهای واضح در مرحله الکتروفورز و نتایج صحیح در تعیین توالی نقش مهمی ایفا می&shy;کند. معمولا </span></span><span dir="LTR" lang="EN-CA" style="font-size:10.0pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times="">CTAB</span></span><span lang="AR-SA" style="font-size:10.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:"> یکی از روش های رایج برای استخراج </span></span><span dir="LTR" lang="EN-CA" style="font-size:10.0pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times="">DNA</span></span><span lang="AR-SA" style="font-size:10.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:"> است که برای برگ&shy;های قدیمی نمونه&shy;های هرباریومی سرده تمشکین </span></span><span dir="LTR" lang="EN-CA" style="font-size:10.0pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times="">(<i>Bellevalia</i>)</span></span><span lang="AR-SA" style="font-size:10.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:"> که متابولیت های ثانویه با اثر بازدارندگی دارد مناسب نسیت. برای حل این مسئله، تغییراتی در مراحل مختلف </span></span><span dir="LTR" lang="EN-CA" style="font-size:10.0pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times="">CTAB</span></span><span lang="AR-SA" style="font-size:10.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:"> اعمال شد و ترکیبات زغال فعال، فنل، استات پتاسیم و </span></span><span dir="LTR" lang="EN-CA" style="font-size:10.0pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times="">RNase</span></span><span lang="AR-SA" style="font-size:10.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:"> استفاده شد و آب دیونیزه جایگزین </span></span><span dir="LTR" lang="EN-CA" new="" roman="" style="font-family:" times="">Tris EDTA</span><span lang="AR-SA" style="font-size:10.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:"> شد تا ناخالصی&shy;ها حذف شده و </span></span><span dir="LTR" lang="EN-CA" style="font-size:10.0pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times="">DNA</span></span><span lang="AR-SA" style="font-size:10.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:"> با کیفیت تری بدست آید. داده&shy;های میزان جذب </span></span><span dir="LTR" lang="EN-CA" style="font-size:10.0pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times="">DNA</span></span><span lang="AR-SA" style="font-size:10.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:"> روش جدیدبا روش </span></span><span dir="LTR" lang="EN-CA" style="font-size:10.0pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times="">CTAB</span></span><span lang="AR-SA" style="font-size:10.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:"> در طول موج&shy;های ۲۶۰ و ۲۸۰ نانومتر مقایسه شد. نتایج، تغییر ۱۵تا۸۰ برابری در غلظت </span></span><span dir="LTR" lang="EN-CA" style="font-size:10.0pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times="">DNA</span></span><span lang="AR-SA" style="font-size:10.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:"> را نشان داد. این مطالعه روش اصلاح شده&shy;ای را پیشنهاد می&shy;کند که امکان استخراج </span></span><span dir="LTR" lang="EN-CA" style="font-size:10.0pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times="">DNA</span></span><span lang="AR-SA" style="font-size:10.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:"> با کیفیت بالاتری نسبت به روش </span></span><span dir="LTR" lang="EN-CA" style="font-size:10.0pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times="">CTAB</span></span><span lang="AR-SA" style="font-size:10.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:"> را از برگ&shy;های قدیمی نمونه های هرباریومی</span></span> <i><span dir="LTR" lang="EN-CA" style="font-size:10.0pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times="">Bellevalia</span></span></i> <span lang="AR-SA" style="font-size:10.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:">&nbsp;امکان&shy;پذیر می&shy;کند.</span></span></span></span></span></span></span><br /> <span style="font-size:11pt"><span style="line-height:normal"><span style="text-autospace:none"><span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span style="font-family:Calibri,sans-serif"><b><span dir="LTR" lang="EN-CA" style="font-size:10.0pt"><span style="font-family:"Times New Roman",serif"></span></span></b></span></span></span></span></span></span><br /> <br /> <span style="font-size:11pt"><span style="line-height:normal"><span style="text-autospace:none"><span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span style="font-family:Calibri,sans-serif"><b><span dir="LTR" style="font-size:12.0pt"><span style="font-family:"Times New Roman",serif"></span></span></b></span></span></span></span></span></span><br /> &nbsp; <span style="font-size:11pt"><span style="line-height:normal"><span style="font-family:Calibri,sans-serif"><span lang="EN-CA" style="font-size:10.0pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times="">High-quality DNA extraction plays an important role to make sharp bands in the <a name="_Hlk91136722">gel electrophoresis </a>and also produces clean chromatograms. Usually, DNA extract is delivered using the modified CTAB method but this method cannot obtain high-quality DNA for molecular analysis from old dried leaves of <i>Bellevalia </i>due to having different chemical compounds which inhibit to obtain a clear DNA extraction. To solve the problem, in different phases of a modified CTAB protocol, activated carbon, phenol, potassium acetate, RNase and deionized water (instead of TE) were applied to eliminate contaminants and improve obtained high-quality DNA. The DNA absorption data from the modified method were compared with CTAB method in 260 and 280 nm wavelengths. The results showed a 15-80-fold change in the DNA concentration. This study suggests the modified method of extraction is more efficient in the quality of DNA obtained from the little amount of herbarium old leaves of <i>Bellevalia</i> than that of the CTAB method.</span></span></span></span></span><br /> <br /> &nbsp; تمشکین, خالص سازی DNA, زغال فعال, فنل, نانودراپ activated charcoal, Bellevalia, DNA purification, phenol, nanodrop 124 131 http://nbr.khu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-404-1&slc_lang=en&sid=1 Lida Jalali Roudsary لیدا جلالی رودسری lidajalali_ro@yahoo.com 100319475328460011265 100319475328460011265 No Department of Biology, Mashhad Branch, Islamic Azad University, Mashhad, Iran گروه زیست شناسی، واحد مشهد، دانشگاه آزاد اسلامی، مشهد، ایران Azarnoosh Jafari آذرنوش جعفری azarnoosh_djafari@mshdiau.ac.ir 100319475328460011266 100319475328460011266 Yes Department of Biology, Mashhad Branch, Islamic Azad University, Mashhad, Iran گروه زیست شناسی، واحد مشهد، دانشگاه آزاد اسلامی، مشهد، ایران Jamil Vaezi جمیل واعظی vaezi@um.ac.ir 100319475328460011267 100319475328460011267 No Department of Biology, Mashhad Branch, Islamic Azad University, Mashhad, Iran; Department of Biology, Faculty of Sciences, Ferdowsi University of Mashhad, Mashhad, Iran گروه زیست شناسی، واحد مشهد، دانشگاه آزاد اسلامی، مشهد، ایران؛ گروه زیست شناسی، دانشکده علوم، دانشگاه فردوسی مشهد Ehsan Karimi احسان کریمی ehsankarimi@mshdiau.ac.ir 100319475328460011268 100319475328460011268 No Department of Biology, Mashhad Branch, Islamic Azad University, Mashhad, Iran دانشگاه آزاد اسلامی مشهد