<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Nova Biologica Reperta</title>
<title_fa>یافته‌‌های نوین در علوم زیستی</title_fa>
<short_title>NBR</short_title>
<subject>Basic Sciences</subject>
<web_url>http://nbr.khu.ac.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>2423-6330</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2476-7115</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii></journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.22034/nbr</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid></journal_id_sid>
<journal_id_nlai></journal_id_nlai>
<journal_id_science></journal_id_science>
<language>en</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1396</year>
	<month>9</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2017</year>
	<month>12</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>4</volume>
<number>3</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>ارزيابي تنوع ژنتيكي و گروه بندي اکوتیپ های مختلف  هندوانه با استفاده از نشانگرهاي مولکولی SRAP</title_fa>
	<title>Evaluation of genetic diversity and classification of watermelon (Citrullus lanatus) ecotypes using SRAP molecular markers</title>
	<subject_fa>علوم جانوری</subject_fa>
	<subject>Animal Biology</subject>
	<content_type_fa>مقاله پژوهشی</content_type_fa>
	<content_type>Original Article</content_type>
	<abstract_fa>&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;تعداد 38 توده و رقم مهم هندوانه از مناطق مختلف کشور جمع&amp;shy; آوری و پس &amp;shy;از آماده&amp;shy; سازی خاک، در مزرعۀ تحقیقاتی در قالب طرح بلوک&amp;shy; های کامل تصادفی با سه تکرار&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;کشت شد. به&amp;shy; منظور بررسی تنوع ژنتیکی، &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;DNA&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; از برگ استخراج و واکنش زنجیره&amp;shy;ای پلیمراز با استفاده از 14 جفت آغازگر &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;SRAP&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;بهینه شد&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;. تعداد 136 باند چندشكل به &amp;shy;دست آمد، كه &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;جفت &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;آغازگر &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;EM10-Me4&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; با تعداد نوزده&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;باند و جفت آغازگرهای&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;EM16-Me4 &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;&amp;nbsp;و &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;EM16-Me4&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; با تعداد &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;هفت&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; باند به &amp;shy;ترتیب بيشترين و كمترين تعداد باند چندشكل را ايجاد کردند. محتواي اطلاعات چندشكل (&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;PIC&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;) در اين تحقيق بين 20/0 تا 32/0 و ميزان تنوع ژني براساس شاخص نی از 17/0 تا 28/0 به &amp;shy;دست آمد. تجزيۀ تابع تشخيص خطي فيشر نشان داد که روش&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;&amp;nbsp;UPGMA&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;و با انجام صحت گروه&amp;shy;بندي در حدود&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;90&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;درصد، مناسب&amp;shy;تر از ديگر روش&amp;shy; هاي تجزيۀ خوشه&amp;shy; اي است. تجزيۀ خوشه &amp;shy;اي&amp;nbsp; &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;براساس روش جاکارد &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;توده &amp;shy;های تحت مطالعه را در پنج گروه مجزا قرار داد. تجزیه به مختصات اصلی نشان &amp;nbsp;می&amp;shy;دهد که مؤلفه&amp;shy; های اول و دوم 5/92&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;درصد از تنوع به&amp;shy; دست &amp;shy;آمده را توجیه می&amp;shy; کنند که خود نشان &amp;shy;دهندۀ توزیع مناسب نشانگرها در کل ژنوم است.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;</abstract_fa>
	<abstract>Thirty eight ecotypes of watermelon were collected from different parts of Iran. After the preparation of the field, these eotypes were cultivated in a completely randomized block design with three replications. In order to invest-igate genetic diversity, genomic DNA samples were extracted from leaves and Polymerase chain reactions were optimized using 14 SRAP primer pairs. One hundred thirty six polymorphic bands were detected, of which the EM10-Me4 was the most abundant primer pair with 19 bands and EM16-Me4 and EM16-Me14 were the least primer pairs with 7 bands. PIC index varied from 0.20 to 0.32 and genetic diversity was 0.17 to 0.28 on the basis of Nei index. Fisher&amp;#39;s Linear Detection Analysis showed that the UPGMA method and the grouping accuracy of about 90% are more appropriate than other cluster analysis methods. Cluster analysis, using Jakard method, was performed and the ecotypes studied were classified into five distinct groups. Based on the PCA, the first and second components included 92.5% of the variation, which represents the proper distribution of the markers on the whole genome.</abstract>
	<keyword_fa>تجزیۀ خوشه ای,  تنوع ژنتیکی,PCR , SRAP</keyword_fa>
	<keyword>cluster analysis, genetic diversity, PCR, SRAP</keyword>
	<start_page>201</start_page>
	<end_page>208</end_page>
	<web_url>http://nbr.khu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-302-3&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Maryam</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Abdoli Nasab</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>مریم</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>عبدلی نسب</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846008767</code>
	<orcid>10031947532846008767</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Graduate University of Advanced Technology, Kerman,</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه تحصیلات تکمیلی صنعتی و فناوری پیشرفتۀ کرمان</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Mehdi</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Rahimi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>مهدی</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>رحیمی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846008768</code>
	<orcid>10031947532846008768</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Graduate University of Advanced Technology, Kerman,</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه تحصیلات تکمیلی صنعتی و فناوری پیشرفتۀ کرمان</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
