Nova Biologica Reperta

fa جداسازی و شناسایی باکتری های تولیدکنندۀ آنزیم کوتیناز Isolation and identification of cutinase enzyme producing bacteria علوم گیاهی Plant Biology مقاله پژوهشی Original Article آنزیم کوتیناز جزء خانوادۀ آنزیمی سرین هیدرولازها بوده که توانایی هیدرولیز انواع استرها و پلی استرهای کوچک مانند کوتین را دارد. کوتین گیاهان از ترکیبات پلی استری هیدروکسی و اپوکسی اسید چرب تشکیل شده است که در مقابل آب نفوذناپذیر است و تنها باکتری های بیماری زای گیاهی  قادر به تجزیۀ آن هستند. به منظور شناسایی این مقاومت، در ابتدا میوه های خیار (Cucumis sativus-' C. sativus')، سیب زرد (Golden Delicious apple 'Malus domestica') ، سیب قرمز (Red Delicious apple 'Malus domestica'') و گوجه فرنگی (Solanum lycopersicum Mill. Commun ' S. lycopersicum') تهیه و از پوست این میوه ها به روش کلرفرم متانول، کوتین استخراج و میزان آن در این میوه ها مقایسه شد. سپس، با استفاده از محیط کشتی اختصاصی حاوی کوتین و سنجش فعالیت آنزیمی، جداسازی سویه های تولیدکنندۀ آنزیم انجام شد. از نمونه های غربال شده، DNA استخراج شد و واکنش PCR به کمک پرایمرهای یونیورسال براساس 16s DNA جهت شناسایی نمونه ها انجام گرفت. در ادامۀ مطالعات بیوانفورماتیک، شناسایی و ثبت نمونه ها در ژن   بانک انجام شد. نتایج نشان میداد که درصد کوتین استخراجشده در سیب بیشتر است و احتمالاً سیب درمقابل آفات و بیماری ها مقاوم تر است. همچنین، شش سویۀ تولیدکنندۀ آنزیم کوتیناز از جنس  Klebsiella و Enterobacter به کمک بررسی فعالیت آنزیمی و محیط کشت اختصاصی حاوی کوتین جداسازی و توالی کدکنندۀ ناحیۀ 16s DNA این باکتری ها در ژن بانک ثبت شد Cutinase belongs to the family of serine hydrolases which are capable of hydrolysis of esters and small polyester such as cutin. The cutin of plants is composed of hydroxy and epoxy fatty acids and is substantially imperm-eable to water and only the plant pathogenic bacteria are capable of degrading it. Initially, in order to identify the extent of cutin in cucumber (Cucumis sativus' C. sativus'), golden apples (Golden Delicious apple 'Malus domestica'), red ap-ples (Red Delicious apple 'Malus domestica'') and tomatoes (Solanum lycopersicum Mill. Commun ' S. lycopersicum'), their fruits were obtained. Cutin was extracted from the fruit skin of each studied specimen and compared by chloro-form-methanol method. Then, isolation of enzyme-producing strains was performed by the use of the specific medium containing cutin and enzyme activity assay. DNA of the specimens was extracted, and PCR were performed with univ-ersal primers for 16s DNA. The remainder was devoted to bioinformatic analysis, identification and registration of samples in the gene bank. The results showed that the percentage of extracted cutin in red apple was more than other samples and as a result, red apple are expected to be more resistant against diseases and pests. Also, six cutinase-prod-ucer strains of Klebsiella and Enterobacter were isolated with the help of enzyme activity and special culture medium containing cutin, and their 16s DNA region coding sequences were recorded in the GenBank. کوتین, سنجش فعالیت, بیوانفورماتیک, پارا نیتروفنل بوتیرات, 16s DNA cutin, activity assay, bioinformatics, PNPB, 16s DNA 39 47 http://nbr.khu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-81-56&slc_lang=fa&sid=1 Nasrin Parvaresh نسرین پرورش 10031947532846002844 10031947532846002844 No Graduate University of Advanced Technology, Kerman دانشگاه تحصیلات تکمیلی صنعتی و فناوری پیشرفته کرمان Mojtaba Mortazavi مجتبی مرتضوی 10031947532846002845 10031947532846002845 Yes Graduate University of Advanced Technology, Kerman دانشگاه تحصیلات تکمیلی صنعتی و فناوری پیشرفته کرمان Masoud Torkzadeh-Mahani مسعود ترک زاده ماهانی 10031947532846002846 10031947532846002846 No Graduate University of Advanced Technology, Kerman دانشگاه تحصیلات تکمیلی صنعتی و فناوری پیشرفته کرمان