<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Nova Biologica Reperta</title>
<title_fa>یافته‌‌های نوین در علوم زیستی</title_fa>
<short_title>NBR</short_title>
<subject>Basic Sciences</subject>
<web_url>http://nbr.khu.ac.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>2423-6330</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2476-7115</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii></journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.22034/nbr</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid></journal_id_sid>
<journal_id_nlai></journal_id_nlai>
<journal_id_science></journal_id_science>
<language>en</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1397</year>
	<month>6</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2018</year>
	<month>9</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>5</volume>
<number>2</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>بررسی تاریخ تکاملی زیرگونۀ کمرکولی جنگلی در کوه های زاگرس، ایران </title_fa>
	<title>Evolutionary history of subspecies of Eurasian nuthatches (Sitta europaea persica) from Zagros Mountains, Iran </title>
	<subject_fa>ژنتیک</subject_fa>
	<subject>Genetics</subject>
	<content_type_fa>مقاله پژوهشی</content_type_fa>
	<content_type>Original Article</content_type>
	<abstract_fa>&lt;p dir=&quot;RTL&quot; style=&quot;margin: 0cm 0cm 0pt; text-align: justify; line-height: normal;&quot;&gt;&lt;font color=&quot;#000000&quot;&gt;&lt;b&gt;&lt;span b=&quot;&quot; lang=&quot;FA&quot; mso-ansi-font-size:=&quot;&quot; mso-bidi-font-size:=&quot;&quot; style=&quot;font-family: &quot;&gt;&lt;font size=&quot;3&quot;&gt;چکیده. &lt;/font&gt;&lt;/span&gt;&lt;/b&gt;&lt;span b=&quot;&quot; font-size:=&quot;&quot; lang=&quot;FA&quot; mso-ansi-font-size:=&quot;&quot; style=&quot;font-family: &quot;&gt;کمرکولی جنگلی در ناحیۀ اوراسیا با حدود 18 زیرگونه از گسترش وسیعی در جنگل&amp;shy; های کهنسال خزان&amp;shy;کنندۀ پهن &amp;shy;برگ برخوردار است. جمعیت مقیم این پرنده در جنگل&amp;shy; های پهن&#8204;برگ بلوط در رشته کوه زاگرس به عنوان &lt;/span&gt;&lt;span b=&quot;&quot; dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;font-size: 8pt; mso-bidi-font-size: 10.0pt; mso-bidi-font-family: &quot;&gt;&lt;font face=&quot;Times New Roman&quot;&gt;S.e.persica&lt;/font&gt;&lt;/span&gt;&lt;span b=&quot;&quot; font-size:=&quot;&quot; lang=&quot;FA&quot; mso-ansi-font-size:=&quot;&quot; style=&quot;font-family: &quot;&gt; معرفی شده است. هدف از این مطالعه بررسی ساختار ژنتیکی و روابط تکاملی زیرگونۀ کمرکولی جنگلی رشته کوه زاگرس در مقایسه با کلادهای اروپایی (&lt;/span&gt;&lt;span b=&quot;&quot; dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;font-size: 8pt; mso-bidi-font-size: 10.0pt; mso-bidi-font-family: &quot;&gt;&lt;font face=&quot;Times New Roman&quot;&gt;European&lt;/font&gt;&lt;/span&gt;&lt;span b=&quot;&quot; font-size:=&quot;&quot; lang=&quot;FA&quot; mso-ansi-font-size:=&quot;&quot; style=&quot;font-family: &quot;&gt;)، آسیایی (&lt;/span&gt;&lt;span b=&quot;&quot; dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;font-size: 8pt; mso-bidi-font-size: 10.0pt; mso-bidi-font-family: &quot;&gt;&lt;font face=&quot;Times New Roman&quot;&gt;Asian&lt;/font&gt;&lt;/span&gt;&lt;span b=&quot;&quot; font-size:=&quot;&quot; lang=&quot;FA&quot; mso-ansi-font-size:=&quot;&quot; style=&quot;font-family: &quot;&gt;) و قفقازی (&lt;/span&gt;&lt;span b=&quot;&quot; dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;font-size: 8pt; mso-bidi-font-size: 10.0pt; mso-bidi-font-family: &quot;&gt;&lt;font face=&quot;Times New Roman&quot;&gt;Caucasian&lt;/font&gt;&lt;/span&gt;&lt;span b=&quot;&quot; font-size:=&quot;&quot; lang=&quot;FA&quot; mso-ansi-font-size:=&quot;&quot; style=&quot;font-family: &quot;&gt;) است. برای این منظور تعداد 10 فرد از دو ناحیه زاگرس شمالی در استان کرمانشاه و زاگرس جنوبی در استان کهگیلویه و بویراحمد با مجوز از سازمان حفاظت محیط زیست زنده&amp;shy;گیری و نمونه&amp;shy; های خون آنها برداشت شد. مطالعات ژنتیکی با استفاده از 136 توالی کامل ژن &lt;/span&gt;&lt;span b=&quot;&quot; dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;font-size: 8pt; mso-bidi-font-size: 10.0pt; mso-bidi-font-family: &quot;&gt;&lt;font face=&quot;Times New Roman&quot;&gt;ND2&lt;/font&gt;&lt;/span&gt;&lt;span b=&quot;&quot; font-size:=&quot;&quot; lang=&quot;FA&quot; mso-ansi-font-size:=&quot;&quot; style=&quot;font-family: &quot;&gt; (1041جفت باز) مستخرج از بانک ژن و 10 توالی از رشته کوه زاگرس تحت بررسی قرار گرفت. تحلیل&amp;shy;های تبارشناسی با استفاده از مدل &lt;/span&gt;&lt;span b=&quot;&quot; dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;font-size: 8pt; mso-bidi-font-size: 10.0pt; mso-bidi-font-family: &quot;&gt;&lt;font face=&quot;Times New Roman&quot;&gt;TRN +G&lt;/font&gt;&lt;/span&gt;&lt;span b=&quot;&quot; font-size:=&quot;&quot; lang=&quot;FA&quot; mso-ansi-font-size:=&quot;&quot; style=&quot;font-family: &quot;&gt; و رسم درخت بیزین و حداکثر درست نمایی انجام گرفت. همچنین روابط بین هاپلوتایپ&#8204;ها با استفاده الگوریتم&#8204;های اتصال میانه و پارسیمونی تحت بررسی قرار گرفت. نتایج نشان داد که از 10 نمونۀ توالی یابی شده، چهار هاپلوتایپ منحصر به فرد حاصل شد. همچنین تحلیل&#8204;های تبارشناسی حاکی از آن بود که جمعیت&#8204;های زاگرس از تبار قفقازی تفکیک&#8204;پذیر است. همچنین از 10 نمونۀ توالی یابی شده، چهار هاپلوتایپ منحصر به فرد حاصل شد. نتایج آمارۀ &lt;/span&gt;&lt;font face=&quot;Times New Roman&quot;&gt;&lt;span b=&quot;&quot; dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;font-size: 8pt; mso-bidi-font-size: 10.0pt; mso-bidi-font-family: &quot;&gt;F&lt;/span&gt;&lt;sub&gt;&lt;span b=&quot;&quot; dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;font-size: 8pt; mso-bidi-font-size: 10.0pt; mso-bidi-font-family: &quot;&gt;ST&lt;/span&gt;&lt;/sub&gt;&lt;/font&gt;&lt;span b=&quot;&quot; font-size:=&quot;&quot; lang=&quot;FA&quot; mso-ansi-font-size:=&quot;&quot; style=&quot;font-family: &quot;&gt; حاصل از تحلیل واریانس مولکولی &lt;/span&gt;&lt;span b=&quot;&quot; dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;font-size: 8pt; mso-bidi-font-size: 10.0pt; mso-bidi-font-family: &quot;&gt;&lt;font face=&quot;Times New Roman&quot;&gt;(AMOVA)&lt;/font&gt;&lt;/span&gt;&lt;span b=&quot;&quot; font-size:=&quot;&quot; lang=&quot;FA&quot; mso-ansi-font-size:=&quot;&quot; style=&quot;font-family: &quot;&gt; تغییرات معنی&#8204;دار ساختار ژنتیکی را در بین جمعیت&#8204;های مختلف کمرکولی جنگلی را نشان داد. آمارۀ &lt;/span&gt;&lt;font face=&quot;Times New Roman&quot;&gt;&lt;span b=&quot;&quot; dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;font-size: 8pt; mso-bidi-font-size: 10.0pt; mso-bidi-font-family: &quot;&gt;F&lt;/span&gt;&lt;sub&gt;&lt;span b=&quot;&quot; dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;font-size: 8pt; mso-bidi-font-size: 10.0pt; mso-bidi-font-family: &quot;&gt;CT&lt;/span&gt;&lt;/sub&gt;&lt;/font&gt;&lt;span b=&quot;&quot; font-size:=&quot;&quot; mso-ansi-font-size:=&quot;&quot; style=&quot;font-family: &quot;&gt; &lt;span lang=&quot;FA&quot;&gt;نیز حاکی از بروز تغییرات ژنتیکی قابل توجه در بین جمعیت&#8204;های مختلف تبارهای آسیا، اروپا، قفقاز و زاگرس بود. در نهایت جمعیت&#8204;های مختلف کمرکولی جنگلی در اوراسیا را می&#8204;توان به سه گونۀ تکامل نژادی تقسیم نمود و زیرگونه&#8204;ها&#8204;ی &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span b=&quot;&quot; dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;font-size: 8pt; mso-bidi-font-size: 10.0pt; mso-bidi-font-family: &quot;&gt;&lt;font face=&quot;Times New Roman&quot;&gt;S.e.persica&lt;/font&gt;&lt;/span&gt;&lt;span b=&quot;&quot; font-size:=&quot;&quot; mso-ansi-font-size:=&quot;&quot; style=&quot;font-family: &quot;&gt; &lt;span lang=&quot;FA&quot;&gt;و &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span b=&quot;&quot; dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;font-size: 8pt; mso-bidi-font-size: 10.0pt; mso-bidi-font-family: &quot;&gt;&lt;font face=&quot;Times New Roman&quot;&gt;S.e.caucasian&lt;/font&gt;&lt;/span&gt;&lt;span b=&quot;&quot; font-size:=&quot;&quot; lang=&quot;FA&quot; mso-ansi-font-size:=&quot;&quot; style=&quot;font-family: &quot;&gt; را بعنوان دو گونۀ تکامل نژادی مشترک در نظر گرفت. &lt;/span&gt;&lt;/font&gt;&lt;/p&gt;
</abstract_fa>
	<abstract>&lt;p style=&quot;margin: 0cm 0cm 0pt; text-align: justify; line-height: normal; unicode-bidi: embed; direction: ltr;&quot;&gt;&lt;font color=&quot;#000000&quot;&gt;&lt;font face=&quot;Times New Roman&quot;&gt;&lt;b&gt;&lt;span new=&quot;&quot; style=&quot;font-size: 10pt; mso-bidi-font-family: &quot; times=&quot;&quot;&gt;Abstract. &lt;/span&gt;&lt;/b&gt;&lt;span new=&quot;&quot; style=&quot;font-size: 10pt; mso-bidi-font-family: &quot; times=&quot;&quot;&gt;Eurasian Nuthatch (&lt;i&gt;Sitta europaea&lt;/i&gt;), with 18 subspecies, has a wide distribution in deciduous forests of Eurasia. The subspecies &lt;i&gt;S.e.persica &lt;/i&gt;is a resident bird in the Zagros Mountains, from north-west to south-west of Iran. The aim of this study was to evaluate the taxonomic and phylogenetic relationships of this subspecies to European, Asian, as well as Caucasian clades. For this purpose, 10 individuals of two populations from Zagros forests in Kermansha and Kohgiluyeh and Boyer-Ahmad provinces were captured and blood samples were collected. Furthermore, we used ND2 sequence data (1041 bp) for 136 sequnces from GenBank. were used from Then genetic variations and Genealogical analysis was calculated using complete ND2 gene sequence (1041bp) and TRN+G model, Bayesian trees and maximum likelihood, respectively. Also, median joining algorithm showed the relationships among haplotypes. We found four new haplotypes for the Zagros populations. Our phylogenetic analysis revealed that the genetic distance between Zagros population and Caucasian clade was significantly small, demonstrating Zagros populations are part of the Caucasian clade. &lt;i&gt;F&lt;/i&gt;&lt;sub&gt;ST &lt;/sub&gt;statistical values, resulted from Analysis of Molecular Variance (AMOVA), represented significant variations in genetic structure among Eurasian Nuthatch populations. Moreover, &lt;i&gt;F&lt;/i&gt;&lt;sub&gt;CT &lt;/sub&gt;revealed significant variation among European, Asian, and Caucasian clades. Overall our result suggests that Eurasian Nuthatch populations in Eurasia comprise three phylogenetic species, and likely biological species. Hoewever, the previous nomenclatured subspecies, &lt;i&gt;S.e.caucasian &lt;/i&gt;and&lt;i&gt; S.e.persica&lt;/i&gt;, can be considered as a common phylogenetic species. &lt;/span&gt;&lt;/font&gt;&lt;/font&gt;&lt;/p&gt;
</abstract>
	<keyword_fa>اوراسیا, روابط فیلوژنی, گونۀ تکامل نژادی, میتوکندری, نشانگر ND2ND2</keyword_fa>
	<keyword>Phylogenetic relationship, phylogenetic species, mtDNA marker, ND2</keyword>
	<start_page>155</start_page>
	<end_page>167</end_page>
	<web_url>http://nbr.khu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-309-4&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>masoud</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>nazarizadeh</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>مسعود</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>نظری زاده</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>nazarizadeh1990</email>
	<code>10031947532846005264</code>
	<orcid>10031947532846005264</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>university of tehran</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه تهران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>mohammad</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>kaboli</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>محمد</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>کابلی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>mkboli@ut.ac.ir</email>
	<code>10031947532846005265</code>
	<orcid>10031947532846005265</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>university of tehran</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه تهران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>hamidreza</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>rezai</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>حمیدرضا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>رضایی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>rezaei@gau.ac.ir</email>
	<code>10031947532846005266</code>
	<orcid>10031947532846005266</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Gorgan University of Agricultural Sciences and Natural Resources</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه منابع طبیعی و کشاورزی گرگان</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>jalil</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>imani</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>جلیل</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>ایمانی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>jalil.imani@ut.ac.ir</email>
	<code>10031947532846005267</code>
	<orcid>10031947532846005267</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Islamic Azad University</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه آزاد اسلامی</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>alireza</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>mohammadi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>علیرضا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>محمدی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>armohammadi1989@gmail.com</email>
	<code>10031947532846005268</code>
	<orcid>10031947532846005268</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>university of tehran</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه تهران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>saeid</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>khaki</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>سعید</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>خاکی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>saeidkhaki30@ut.ac.ir</email>
	<code>10031947532846005269</code>
	<orcid>10031947532846005269</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>university of tehran</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه تهران</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
