یافته های نوین در علوم زیستی

شجره شناسی ماهی قزل‌آلای خال‌قرمز (Salmo trutta L. 1758) رودخانه جاجرود با استفاده از توالی ناحیه D-Loop

نویسندگان

غفار خسروانی اصل 1
ایرج هاشم زاده سقرلو 1
اسماعیل پیرعلی 1
اصغر عبدلی 2

1 دانشگاه شهرکرد

2 دانشگاه شهیدبهشتی

https://doi.org/10.21859/acadpub.nbr.3.1.39
چکیده
در این بررسی روابط شجره­ شناسی ماهی قزل­آلای خال قرمز Salmo trutta L.1758 در رودخانه جاجرود حوضه دریاچه نمک با استفاده از توالی کامل ناحیه D-Loop ژنوم میتوکندریایی 5 قطعه ماهی در مقایسه با دیگر جمعیت­ های این گونه در ایران بررسی شد. نتایج به دست آمده نشان داد که جمعیت ماهی قزل­آلای خال­قرمز رودخانه جاجرود نیز مثل دیگر جمعیت­ه ای ایرانی این ماهی متعلق به گروه شجره شناسی دانوب است. هاپلوتایپ مشاهده شده در جمعیت رودخانه جاجرود مشابه هاپلوتایپ گزارش شده در جمعیت رودخانه کرج است. با توجه به نتایج به دست آمده ماهی قزل­آلای خال­قرمز حوضه نمک به جمعیت­های حوضه خزر نسبت داده شد و نسبت آن با گونه Salmo macrostigma مورد تأیید قرار نگرفت. با توجه به مشاهده نشدن هاپلوتایپ جمعیت­ های کرج و جاجرود در حوضه خزر و روابط آن با دیگر هاپلوتایپ­ های ایرانی و دانوبی شاید بتوان این هاپلوتایپ را از هاپلوتایپ های قدیمی دانست که ممکن است در حوضه خزر هم وجود داشته باشند. با توجه به بحث­های موجود در رابطه با زیست شناسی، ویژگی­ های جغرافیایی و همچنین با توجه به نوع هاپلوتایپ ماهی قزل­آلای خال ­قرمز حوضه نمک می­توان عنوان نمود که این جمعیت­ ها احتمالاً بومی حوضه نمک بوده و توسط انسان به حوضه یادشده معرفی نشده­ اند.

کلیدواژه‌ها

ژنوم میتوکندری
ماهی قزل‌آلا
حوضۀ خزر
هاپلوتایپ قدیمی
بومی

عنوان مقاله English

The phylogenetic position of Brown trout (Salmo trutta L. 1758) in the Jajrud River using D-Loop sequence

نویسندگان English

Qaffar Khosravani asl 1
Iraj Hashemzade Sagharloo 1
Esmaeel Pirali 1
Asghar Abdoli 2
چکیده English

In this study phylogenetic relationship of the Jajrud River Brown trout Salmo trutta L. 1758 in the Namak Lake basin was analyzed using complete D-Loop sequence of the mitochondrial genome, compared to other Iranian populations of the species. The results clarified that Jajrud brown trout, similar to other Iranian brown trout populations belongs to the Danube phylogenetic lineage. The observed haplotype in the Jajrud population is similar to the reported haplotype in the Karaj River. Based on the results the Namak Lake basin brown trout affined to the Caspian populations and its relationship to Salmo macrostigma was not confirmed. Since the Karaj and Jajrud River haplotypes have not been observed in the Caspian Sea basin and because of its relationship to other Iranian and Danube haplotypes it is plausible to consider this haplotype as an old haplotype that also may exist in the Caspian Sea basin. According to the biology of Brown trout, geographic characteristics, and based on the properties of the Namak haplotype it may be inferred that the Namak Basin Brown trout populations are native to the basin and are not introduced.

کلیدواژه‌ها English

mitochondrial genome
trout
Caspian basin
old haplotype
Native
سازمان جغرافیایی نیروهای مسلح. 1383. فرهنگ جغرافیایی رودهای کشور: حوضۀ آبریز ایران مرکزی. انتشارات سازمان جغرافیایی نیروهای مسلح. صفحه 14.
Altschul, S.F., Madden, T. L., Schäffer, A.A., Zhang, J., Zhang, Z., Miller, W. and Lipman, D.J. 1997. Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs. –Nucleic Acids Res. 25(17): 3389-3402.
Bernatchez, L. 2001. The evolutionary history of brown trout (Salmo trutta L.) inferred from phylo-geographic, nested clade, and mismatch analyses of mitochondrial DNA variation. – Evolution 55: 351-379.
Clement, M., Posada, D. & Crandall, K.A. 2000. TCS: a computer program to estimate gene genologies. – Mol. Ecology 9(10): 1657-1660.
Coad, B. 2015. Freshwater Fishes of Iran. Available at http://www.briancoad.com/contents.
Elliot, J.M. 1994. Quantitative Ecology and the Brown Trout. Oxford: Oxford University Press.
Estoup, A., Largiad`er, C.R., Perrot, E. and Chourrout, D. 1996. Rapid one tube DNA extraction for reliable PCR detection of fish polymorphic markers and transgenes. – Mol. Marine Biol. Biotech. 5: 295-298.
Freeland, J.R. 2005. Molecular Ecology. Chichester: John Wiley & Sons, Ltd.
Hallerman, E.M. 2003. Population genetics: principles and applications for fisheries scientists. –American Fisheries Society.
Hashemzadeh Segherloo, I., Farahmand, H., Abdoli, A., Bernatchez, L., Primmer, C.R., Swatdipong, A., Karami, M. and Khalili, B. 2012. Phylogenetic status of brown trout Salmo trutta populations in five rivers from the southern Caspian Sea and two inland lake basins, Iran: a morphogenetic approach. – J. Fish Biol. 81: 1479-1500.
Swatdipong, A., Karami, M. and Khalili, B. 2012. Phylogenetic status of brown trout Salmo trutta Populations in five rivers from the southern Caspian Sea and two inland lake basins, Iran: a morphogenetic approach.-J. Fish Biol. 81: 1479-1500
Maric, S., Susnik, S., Simonovi´c, P. and Snoj, A. 2006. Phylogeographic study of brown trout from Serbia, based on mitochondrial DNA control region analysis. – Genetics Selection Evolution 38: 411-430.
Saadati, M.A.G. 1977. Taxonomy and Distribution of the Freshwater Fishes of Iran. MS Thesis. Colorado State University: Fort Collins, Co, USA.
Suarez, J., Bautista, J.M., Almod´ovar, A. and Machordom, A. 2001. Evolution of the mitochondrial control region in Palaearctic brown trout (Salmo trutta) populations: the biogeographical role of the Iberian Peninsula. –Heredity 87: 198-206.
Tamura, K., Stecher, G., Peterson, D., Filipski, A. and Kumar, S. 2013. MEGA6: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 6.0. – Mol. Biol. Evolution 30: 2725-2729.
Thompson, J.D., Gibson, T. and Higgins, D.G. 2002. Multiple sequence alignment using ClustalW and ClustalX. – Current Protocols in Bioinformatics 2-3.

  • تاریخ دریافت 18 خرداد 1405
  • تاریخ انتشار 18 خرداد 1405

صفحه اصلی

راهنمای نویسندگان

ارسال مقاله

داوران

تماس با ما