طیف نگاری ساختار DNA به کمک رنگدانه های مصنوعی با استفاده از نور LED

نویسندگان

آزمایشگاه فوتونیک، دانشکدۀ فیزیک، دانشگاه خوارزمی، تهران

چکیده
واضح است که دستگاه ­های تشخیص غلظت DNA در زمینه­ های ژنتیک و زیستی و بیوتکنولوژی کاربرد زیادی دارند. بر این اساس، تعدادی دستگاه مشابه با نور لیزر طراحی شده است که معایب آن قیمت بالا و استفاده از مقادیر قابل ملاحظه از نمونه می ­باشد. دستگاه طراحی شده با نور LEDکار می­ کند که هزینۀ ساخت این دستگاه را بسیار ارزان­تر می­ کند. مقادیر DNA استفاده شده در این دستگاه بسیار کم و در حدود چند میکرولیتر می­ باشد و اندازه ­گیری سریع و کوچک و قابل حمل بودن آن نیز از امتیازات این دستگاه می­ باشد. داده­ های خروجی از این دستگاه به صورت ولتاژ بر حسب زمان و تبدیل فوریه آن، یعنی تبدیل فرکانسی ثبت می­ شود. از نمودارهای فرکانسی بدست آمده می ­توان با استفاده از قانون بیرلامبرت به غلظت نسبی DNA و سنجش ویروس­ ها و اندازه­ گیری میزان آسیب به DNA و کاربردهای بسیار دیگر پی برد. با استفاده از این دستگاه، غلظت DNAهای رنگ شده با سه رنگینۀ مختلف توسط دستگاه فلورومتر اندازه ­گیری شد.

کلیدواژه‌ها


عنوان مقاله English

DNA structure spectroscopy by synthetic pigments using LED lighting

نویسندگان English

Seyed Milad Hashemi
Somayeh Salmani
Mohammad Hossein Majles Ara
Photonic Lab, Faculty of Physics, Kharazmi University, Tehran, Iran
چکیده English

It is clear that DNA concentration and biological detection devices have many applications in the fields of genetics and biotechnology. For this goal, some similar devices have been designed working with the laser light which the disadvantages of them are high prices and the use of significant amounts of sample volume. But this designed device which works with LED light has very cheap manufacturing cost. The amounts of DNA used in this device are very low, about a few micro-liters and measurement of small, fast and portable it is also the advantages of these devices. The Data recorded as voltage versus time and the Fourier transform the frequency domain. From the frequency curve, by using the Byrlambrt it is possible to obtain the relative concentrations of DNA, viruses and assays measuring DNA damage and many other applications. By use of this device, the concentration of DNA colored with three different pigments was measured.

کلیدواژه‌ها English

pigments
fluormeter
Frequency
Concentration
DNA
Alberti, P. and Mergny, J.L. 2003. DNA duplex-quadruples exchange as the basis for a nanomolecular machine. – PNAS 100: 1569-1573.
Heller, M.J. and Morrison, L.E. 1985. In Rapid detection and identification of infectious agents. – Academic Press, New York. pp: 245-256.
Mao, C., Sun, W., Shen, Z. and Seeman, N.C. 1999. A nanomechanical device based on the B-Z transition of DNA. – Nature 297: 144-146.
Niemeyer, C. and Adler, M. 2002. Nanomechanical devices based on DNA. – Angew. Chem. Int. Ed. 41: 3779-3783.
Simmel, F.C. and Yurke, B. 2002. A DNA-based molecular device switchable between three distinct mechanical states. – Appl. Phys. Lett. 80: 883-885.
Smith, S.B., Finzi, L. and Bustamante, C. 1992. Direct mechanical measurements of the elasticity of single DNA molecules by using magnetic beads. – Science 258: 1122-1126.
Stryer, L. and Haugland, R.P. 1967. Energy transfer: a spectroscopic ruler. – Proc. Natl. Acad. Sci. USA 58: 719-726.
Yan, H., Zhang, X., Shen, Z. and Seeman, N.C. 2002. A robust DNA mechanical device controlled by hybridization topology. – Nature 415: 62-65.
Yurke, B., Turberfield, A.J., Mills, Jr., A.P., Simmel, F.C. and Neumann, J.L. 2000. A DNA fuelled molecular machine made of DNA. – Nature 406: 605-608.

  • تاریخ دریافت 18 خرداد 1405
  • تاریخ انتشار 18 خرداد 1405