دانشگاه خوارزمی یافته های نوین در علوم زیستی 2423-6330 9 2 2022 08 23 A simple and efficient DNA extraction protocol for old herbarium leaves of Bellevalia (Asparagaceae, Scilloideae) دستورالعمل ساده و کارآمد استخراج DNA برای برگ‌های قدیمی و هرباریومی تمشکین (تیره مارچوبه‌ایان) 124 131 9252 10.52547/nbr.9.2.124 FA لیدا جلالی رودسری گروه زیست شناسی، واحد مشهد، دانشگاه آزاد اسلامی، مشهد، ایران آذرنوش جعفری گروه زیست شناسی، واحد مشهد، دانشگاه آزاد اسلامی، مشهد، ایران جمیل واعظی گروه زیست شناسی، واحد مشهد، دانشگاه آزاد اسلامی، مشهد، ایران؛ گروه زیست شناسی، دانشکده علوم، دانشگاه فردوسی مشهد 0000-0002-6931-6754 احسان کریمی دانشگاه آزاد اسلامی مشهد Journal Article 2026 06 08 High-quality DNA extraction plays an important role to make sharp bands in the gel electrophoresis and also produces clean chromatograms. Usually, DNA extract is delivered using the modified CTAB method but this method cannot obtain high-quality DNA for molecular analysis from old dried leaves of Bellevalia due to having different chemical compounds which inhibit to obtain a clear DNA extraction. To solve the problem, in different phases of a modified CTAB protocol, activated carbon, phenol, potassium acetate, RNase and deionized water (instead of TE) were applied to eliminate contaminants and improve obtained high-quality DNA. The DNA absorption data from the modified method were compared with CTAB method in 260 and 280 nm wavelengths. The results showed a 15-80-fold change in the DNA concentration. This study suggests the modified method of extraction is more efficient in the quality of DNA obtained from the little amount of herbarium old leaves of Bellevalia than that of the CTAB method. DNA استخراج شده با کیفیت بالا در بدست آمدن باندهای واضح در مرحله الکتروفورز و نتایج صحیح در تعیین توالی نقش مهمی ایفا میکند. معمولا CTAB یکی از روش های رایج برای استخراج DNA است که برای برگهای قدیمی نمونههای هرباریومی سرده تمشکین (Bellevalia) که متابولیت های ثانویه با اثر بازدارندگی دارد مناسب نسیت. برای حل این مسئله، تغییراتی در مراحل مختلف CTAB اعمال شد و ترکیبات زغال فعال، فنل، استات پتاسیم و RNase استفاده شد و آب دیونیزه جایگزین Tris EDTA شد تا ناخالصیها حذف شده و DNA با کیفیت تری بدست آید. دادههای میزان جذب DNA روش جدیدبا روش CTAB در طول موجهای ۲۶۰ و ۲۸۰ نانومتر مقایسه شد. نتایج، تغییر ۱۵تا۸۰ برابری در غلظت DNA را نشان داد. این مطالعه روش اصلاح شدهای را پیشنهاد میکند که امکان استخراج DNA با کیفیت بالاتری نسبت به روش CTAB را از برگهای قدیمی نمونه های هرباریومی Bellevalia امکانپذیر میکند.

https://nbr.khu.ac.ir/article_9252_613690cd913c7e69998dd12df14a96fa.pdf